"Большинство ли ферментов живых организмов построено на связях металл-металл?"
Сорри, но я не знаю ни одного подобного фермента. Тут имхо какая-то ошибка.
Металлы входят в состав ферментов ТОЛЬКО в виде положительных ионов. А добрая половина ферментов не содержит металлов вообще.